Frissítés és újratelepítés esetén a Lazarus nem felejti el a korábbi beállításokat. A korábbi telepítésből származó beállítások az új változathoz lesznek igazítva (rákérdez).
A korábbi telepítéshez hozzáadott komponensek, melyek az alap telepítés esetén nem részei az IDE-nek azonban nem lesznek elérhetők mindaddig amíg az IDE-t újra nem lesz fordítva. Újrafordítás után, a korábbi telepítés beállításainak megfelelően már minden előzőleg telepített komponens elérhető és használható lesz, tehát nem kell őket külön újratelepíteni.
Fontos: Linux/Unix rendszereken történő újrafordítás esetén a rendszerre csomagkezelővel/globálisan telepített IDE nem tudja írni a rendszer védett könyvtárait, ezért a "Tisztítás" nem használható és az újrafordított IDE az elsődleges beállítások könyvtárába kerül (ez alapesetben a felhasználó könyvtárán belül található).
